Huit départements et un secrétariat général
- Département d’évaluation des établissements (DEE)
- Département d’évaluation des organismes (DEO)
- Département d’évaluation de la recherche (DER)
- Département d’évaluation des formations (DEF)
- Département Europe et International (DEI)
- Département du numérique et des données (DND)
- Observatoire des sciences et techniques (OST)
- Office Français de l’Intégrité Scientifique (Ofis)
- Secrétariat général